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美吉生物助力客户登陆Cell子刊--RNA-Seq揭示LSD2的双酶活性

项目文章2016-10-20

  你造吗?美吉生物又创佳绩啦!哦?又有神马好消息了!美吉与上海复旦医学院徐彦辉研究小组合作,研究成果发表于《Molecular cell》杂志上。哇塞,这么高大上啊!它可是大名鼎鼎的cell子刊,影响因子高达14.018呢。快来讲讲这篇大作吧。别急,就让小编为您细细道来。

  2015年4月来自复旦大学医学院的徐彦辉研究组在著名国际期刊Molecular Cell发表了最新研究进展,该研究发现组蛋白去甲基化酶LSD2同时具有E3泛素连接酶活性,LSD2能够依赖其泛素连接酶活性促进O-GlcNAc糖基转移酶降解,从而发挥抗肿瘤功能。

  本研究测序相关工作由美吉生物承担:采用HiSeq 2500测序平台,通过转录组分析在整体水平上研究基因功能,并揭示了特定生物学过程及疾病发生过程的分子机制。

  采用mRNA-Seq方法,揭示了LSD2能够通过其去甲基化酶活性和E3泛素连接酶功能调控不同靶基因表达(图1A)。

            

                图1 depletionoverexpression LSD2导致293TA459细胞系转录组表达谱发生明显变化


    为了理解该基因在细胞中的功能所在,文章进一步对差异表达基因进行GO注释,结果显示在293T细胞中LSD2参与了包括细胞发育,程序性死亡,细胞凋亡,信号传递,蛋白激酶活性等细胞过程 (图2C),而在A459细胞中,LSD2则可以参与类固醇代谢,细胞生长与增值及细胞粘附,免疫反应等过程(图2G,图2H)。这些证据为文中的主题提供了可靠的数据支持。

              

           

                    图2 由LSD2调控的293TA459细胞差异表达基因的GO功能注释分析


    美吉公司衷心祝贺这一高水平文章的发表,十分荣幸能为该文章的转录组研究提供服务,同时非常感谢徐老师研究组对美吉的信任和认可。祝愿美吉的客户能够取得丰硕的成果。
文献原文:
     Yi Yang, Xiaotong Yin, Huirong Yang,Yanhui Xu. Histone Demethylase LSD2 Acts as an E3 Ubiquitin Ligase and Inhibits Cancer Cell Growth through Promoting Proteasomal Degradation of OGT [J]. Molecular Cell. 2015,
4: http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2015.01.038
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