美吉生物

生物培训班 培训班详情

2015年冬季生物信息分析培训班——多样性&宏基因组专题

开课时间:2015年12月28日—2016年01月07日
¥3000
报名截止日期: 开课名额: | 已报名:
课程介绍 课程表

主办单位:上海美吉生物医药科技有限公司

培训时间:2015年12月28日—2016年1月7日

 

培训特色

       根据老师们需求针对性的开设“入门班”、“进阶班”。

       小班教学,1对1专人指导,保证教学效果。

       讲师拥有丰富的数据分析和软件研发经验。

       主题明确,针对性强。理论与实践结合,针对专题内容进行深入讲解。

       精心挑选上机软件,实用性强,方便学员课下独立操作。

课程对象

       从事多样性科研工作者;

       无需生信分析基础人群。

收费标准
       注册费:“入门班”3000/人,含学费、资料费、培训期间午餐费;

                    “进阶班”4000/人,含学费、资料费、培训期间午餐费。

      培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理。

优惠政策

      学生执学生证享受9折优惠。

报名方式

       联系当地销售

       点击下载下方报名回执表beibei.guo@majorbio.com

付费方式

      现金、支票、转账汇款

      账户信息

      名    称:上海美吉生物医药科技有限公司

      开户行:浦发银行张江支行

      账    号:97160154740003720

      名    称:上海桑格信息技术有限公司

      开户行:浦发银行张江支行

      账    号:97160154740009921

报到注册

      报到时间:2015年12月27日、2016年1月3日

      报到地点:上海市浦东新区康新公路3399弄时代医创园3号楼

联系方式

       联系人:郭老师

       咨询电话:021-51875086-8161,15901949102

       E-mail:beibei.guo@majorbio.com

       报名截止:本次培训名额有限,报名截止日期2015年12月24日(入门班)    2016年1月1日(进阶班)

报名回执表下载

 

“入门班”—多样性

日期

时间

课程

授课内容

1

08:30-11:30

微生物多样性研究概要

多样性研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读

13:00-17:00

Linux入门及基础操作

Linux介绍,常用命令使用、nano编辑器等

18:00

晚宴

2

08:30-11:30

微生物多样性基础分析

常用分析软件及数据库介绍、序列质控、OTU聚类与物种分类、α多样性分析等

13:00-17:00

R语言基础

R软件及R package安装,数据类型,基础语法,常用数据处理方法等

3

08:30-11:30

R语言绘图

R语言绘图系统介绍,常用绘图命令、绘图参数使用等

13:00-17:00

微生物多样性标准分析

相关package安装,群落组成柱图,heatmap图,venn图分析等的实现

4

08:30-11:30

微生物多样性标准分析·续

相似度聚类树、PCA/PCoA分析及RDA/CCA分析等的实现

13:30-17:00

课程回顾、总结、答疑

注:入门班课程是针对无相关生信分析基础的人群设置的,授课内容比较浅显易懂。

① R语言课程主要包含入门基础、数据读写、简单绘图

②微生物多样性标准分析课程,主要包括一些最常用的分析内容及其实现,不会涉及很深的算法和原理

 

“进阶班”—多样性&宏基因组

日期

时间

课程

授课内容

1

08:30-11:30

微生物多样性研究概要

多样性研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读

13:00-17:00

微生物多样性基础分析

常用分析软件及数据库介绍、OTU聚类与物种分类、α多样性分析等的算法、原理和实现

18:00

晚宴

2

08:30-11:30

R语言数据处理与统计分析

数据采集,数据清洗,常规数据运算,统计量运算,常用统计方法介绍和使用

13:00-17:00

R语言统计绘图进阶

统计检验,差异查找,线性回归,方差分析等及其绘图实现(散点图,折线图,boxplot图等)

3

08:30-11:30

微生物多样性标准分析

群落组成分析(柱图,heatmap图),群落比较分析(venn图),相似度聚类树及组合heatmap图等

13:00-17:00

微生物多样性标准分析·续

排序分析(PCA/PCoA分析,NMDS分析及RDA/CCA分析),相似性分析(Anosim),Mantel test分析等

4

08:30-11:30

宏基因组研究概要

包括研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读等

13:30-17:00

宏基因组分析介绍;

课程回顾、总结、答疑

常用宏基因组分析流程和工具介绍

适用于:

①具备微生物多样性分析基本理论知识;

②熟练使用Linux系统进行日常操作(查看,编辑,复制,删除,压缩,执行软件等);

③会使用R语言进行简单数据分析(了解数据类型,基础语法,文件读写,简单绘图命令等);

④有一定编程经验(了解数据类型,变量,表达式,循环,选择等)。

说明:以上课程内容可能会有微调,具体课程信息以实际上课为准。

          上机课程需学员自己携带笔记本电脑

2015年冬季生物信息分析培训班——多样性&宏基因组专题

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