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生物培训班 培训班详情

2014年生物信息分析培训班 ——多样性和转录组专题

¥3000
报名截止日期: 开课名额: | 已报名:
课程介绍 课程表

主办单位:上海美吉生物医药科技有限公司

培训时间:2014年7月14日-8月4日

培训地点:美吉上海总部

 

培训特色

       讲师拥有丰富的数据分析和软件研发经验。

       主题明确,针对性强。理论与实践结合,针对专题内容进行深入讲解。

       精心挑选上机软件,实用性强,方便学员课下独立操作。

课程对象

       从事多样性和转录组学研究的科研工作者;

       无需生信分析基础。

收费标准

       注册费:3000元/人,含学费、资料费、培训期间中餐费、其他材料费;

       培训期间我们会提供一次免费晚宴,加强学员之间的交流;

       培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理。

优惠政策

       学生持学生证享受8折优惠;

       同一单位有4人同时报名参加该期培训班,可额外赠送1个名额。

付费方式

       现金、支票、转账汇款

       账户信息:

       名    称:上海美吉生物医药科技有限公司

       开户行:浦发银行张江支行

       账    号:07656797160154740003720

报到注册

       报道时间:2014年7月13日、7月20日、7月27日、8月3日下午13:00-17:00。

       报道地点:上海浦东新区康新公路3399号时代医创园3号楼美吉生物

联系方式

       联系人:郑老师

       咨询电话:021-51875086-8161,15901949102

       E-mail:huilin.zheng@majorbio.com

       报名截止:本次培训名额有限,报名截止日期6月30日。

报名回执表下载

 

多样性课程

日期

时间

课程

第一天

09:00-11:30

Linux入门及操作基础

13:30-15:30

语言基础

15:50-17:50

多样性基础知识普及&美吉生物的多样性实验特点

18:00

晚宴

第二天

09:00-11:30

多样性分析流程介绍

常用软件(qiime)介绍

13:30-17:00

常用数据库介绍和使用方法

多样性基础分析:OTU聚类与物种分类,α多样性分析

第三天

09:00-11:30

多样性高级分析:群落结构分析,β多样性分析

13:30-17:00

多样性高级分析:群落结构分析,β多样性分析

第四天

09:00-11:30

宏基因组分析流程及常用软件(SOAP de novo、Newbler、metagene)介绍

13:30-17:00

宏基因组数据分析:(以illumina平台数据为例)序列拼接;功能预测;基因注释;

 

转录组课程

日期

时间

课程

第一天

09:00-11:30

RNAseq进展及应用简介,包括研究热点、原理、注意事项等

13:30-15:30

Linux入门及操作

15:30-17:30

R语言入门及操作

18:00

晚宴

第二天

09:00-11:30

有参转录组分析,包括:数据预处理与质量控制、表达量计算、差异基因筛选(实际:边讲边演练)

13:30-17:00

上机演练:

质控(FASTQC)、定量(Tophat)、差异(Cuffdiff)

第三天

09:00-11:30

无参转录组分析,包括:转录组从头组装、功能注释、GO分类、COG分类、代谢通路分析

13:30-17:00

上机演练:

组装(Trinity)、序列比对(Blast及blast2go)

第四天

09:00-10:30

转录组相关高级分析,包括:聚类、功能富集、网络等

10:30-11:30

上机演练:

聚类(cluster)、富集(kobas)、网络(cytoscape)

13:30-15:00

RNAseq经典案例及方案设计

说明:以上课程内容可能会有微调,具体课程信息以实际上课为准。

上机课程需学员自己携带笔记本电脑

2014年生物信息分析培训班 ——多样性和转录组专题

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报名疑问咨询:021-51875086

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